本館原為「苗栗木雕藝術展示館」，是臺灣省政府建設廳為推廣木雕藝術，於一九九○年三月破土興建；同年五月，行政院文化建設委員會依據「加強文化建設」方案重要建設事項：「發展地方特色館」，擇定苗栗縣以三義木雕為地方特色，設木雕專題博物館，復於一九九二年四月核定列入國家建設六年計畫的重要文化建設專案，撥款新台幣五千萬充實展示工程。

本館隸屬於苗栗縣政府文化觀光局，於 一九九五年四月九日 開館，為國內唯一以木雕為專題之公立博物館。建館目標以發揚木雕為主，兼負木雕蒐集、典藏、展示、研究、推廣，並促使主題特色獲得維護、傳續、發揚與創新，成為生生不息，不斷成長的博物館。